生物载体与信息隐藏的核心原理，是借助两类关键技术实现信息的存储与传递：一类是DNA数据储存与隐藏技术。先通过特定算法将二进制数字信息转换为DNA的四种碱基序列，并完成编码，再用DNA合成仪化学合成带有编码的DNA序列，随后把合成的DNA片段混入大量无关DNA中，或直接涂抹在物品表面进行隐藏。后续通过DNA测序技术读取样本中的全部DNA序列，再用解码软件还原原始信息，让DNA这类生物大分子成为天然的高密度信息存储介质。
    另一类是基于合成生物学的信息传递技术。通过基因工程改造细菌，使其基因组携带特定信息，或让细菌在特定环境信号触发下产生可探测的标记物，让微生物成为信息传递的载体。例如，荧光蛋白细菌编程信息技术就是典型应用：通过基因工程将荧光蛋白基因植入细菌体内，使细菌能发出不同颜色的光，这些不同颜色的光会构成一套编码系统，进而完成隐蔽的信息传递。
    目前，生物间谍技术正朝着微型化、智能化、仿生化和高度隐蔽性的方向发展。我们必须筑牢铜墙铁壁。